En resumen
Para la mayoría de autónomos en España, nuestra recomendación es Quipu (mejor contabilidad + modelos fiscales automatizados) o Billin (más simple y potencialmente gratis con el Kit Digital). Debajo tienes el razonamiento completo, las limitaciones honestas de cada una y recomendaciones específicas por tipo de actividad.
Cómo elegimos
Este ranking no es un ranking de comisiones. Incluimos en el top sólo herramientas que cumplen los siguientes criterios objetivos:
- Integración con la AEAT: presentación automática o asistida de modelos 303, 130 y 390.
- Facturación electrónica obligatoria 2026: cumplimiento de los requisitos técnicos de la Ley Crea y Crece para el ejercicio 2026.
- Reputación demostrable: valoración en Trustpilot por encima de 3.5/5 con volumen suficiente de reseñas.
- Transparencia de precios: tarifas públicas, sin letra pequeña en el período de prueba.
- Soporte en español: documentación, equipo de atención y comunicación con Hacienda en castellano.
Recibimos una comisión si contratas a través de nuestros enlaces, pero la comisión no determina el orden en el que aparecen las herramientas. Más abajo mencionamos alternativas no afiliadas que también pueden encajar según el caso.
Ranking 2026
- #1
Quipu
La plataforma más usada por autónomos en España
Trustpilot 4.0/5 con más de 250 reseñasPor qué lo recomendamos
Quipu es la herramienta más completa del mercado español para autónomos que llevan contabilidad de verdad. Automatiza los modelos 303, 130 y 390, concilia el banco, y genera facturas electrónicas sin que tengas que pelearte con la presentación ante la AEAT. Para nosotros es el primer puesto por margen: cubre el ciclo completo (facturación + contabilidad + impuestos) desde una sola plataforma en español.
Limitaciones honestas
- Curva de aprendizaje inicial
- Plan básico limitado
La curva de aprendizaje inicial no es plana — si sólo emites cuatro facturas al mes, Quipu te va a sobrar. Tampoco está bonificado por el Kit Digital, así que para perfiles muy bajos de facturación el coste pesa más.
Ideal para
- Autónomos en estimación directa con contabilidad regular
- PYMES que necesitan presentar modelos trimestrales automatizados
- Actividades con contabilidad completa (comercios, profesionales con gastos)
Herramienta recomendadaPrueba Quipu con nuestro enlace
Valoración de Quipu en Trustpilot: Trustpilot · 4.0/5 con más de 250 reseñasLa plataforma más usada por autónomos en España
- #2
Billin
Factura como autónomo, subvencionado por el Kit Digital
Trustpilot 4.2/5 con más de 180 reseñasPor qué lo recomendamos
Billin es la alternativa sencilla y, para muchos autónomos, gratis. Está bonificado por el Kit Digital, así que si todavía no has gastado la subvención puedes usar sus planes sin pagar un euro durante el período elegible. La interfaz es más ligera que la de Quipu y la experiencia de emisión de facturas está muy pulida: pensado para quien factura poco pero quiere cumplir con la facturación electrónica obligatoria 2026.
Limitaciones honestas
- Menos potente que Quipu para contabilidad avanzada
- Funciones de proyectos limitadas
No es una herramienta de contabilidad completa: para modelos fiscales avanzados, proyectos complejos o conciliación bancaria potente se queda corto frente a Quipu.
Ideal para
- Autónomos que facturan poco y necesitan cumplir la facturación electrónica
- Usuarios del Kit Digital que quieren aprovechar la bonificación
- Negocios con necesidad de factura electrónica simple y profesional
Herramienta recomendadaPrueba Billin con nuestro enlace
Valoración de Billin en Trustpilot: Trustpilot · 4.2/5 con más de 180 reseñasFactura como autónomo, subvencionado por el Kit Digital
Menciones honorables (sin afiliación)
Estas herramientas no forman parte de nuestro programa de afiliados, pero son opciones reconocidas que pueden encajar según el caso. Las mencionamos por transparencia: si ninguna de las anteriores te convence, aquí tienes dos alternativas sólidas.
Holded
ERP más ambicioso, interesante si vas a contratar personal o necesitas CRM integrado con la facturación. Menos enfocado al autónomo puro y con un plan básico que se queda corto para quien sólo quiere facturar.
FacturaDirecta
Opción veterana y sólida para quien prioriza simplicidad sobre ecosistema. La interfaz es menos moderna que la de Billin, pero hace exactamente lo que promete sin intentar vender módulos extra.
Recomendación por tipo de actividad
Mejor programa para autónomos del epígrafe 501.3 (Construcción y albañilería)
Para un autónomo del epígrafe 501.3 nuestra recomendación es Quipu. El flujo típico de construcción mezcla IVA recurrente, gastos de materiales y pagos fraccionados del IRPF, y Quipu automatiza la conciliación bancaria y la presentación del modelo 303 sin que tengas que cuadrarlos a mano cada trimestre.
Mejor programa para profesionales (epígrafes de la sección segunda)
Los profesionales en estimación directa (abogados, consultores, diseñadores) suelen facturar menos operaciones pero con importes mayores y retenciones aplicadas. Quipu es la opción por defecto por su cálculo del modelo 130 y las retenciones del 15%; si el volumen de facturación es bajo y quieres ahorrar en software, Billin cumple con el mínimo legal y puede salir gratis con el Kit Digital.
Mejor programa para comerciantes minoristas (epígrafes 641 a 665)
El comercio minorista necesita facturación electrónica simple, control de tickets y gestión básica de inventario. Billin encaja especialmente bien en este perfil por la sencillez de emitir facturas y capturar gastos desde el móvil. Si la actividad crece hacia contabilidad completa o empiezas a acumular proveedores, Quipu escala mejor sin forzarte a cambiar de herramienta.
Mejor programa para autónomos en módulos (estimación objetiva)
Los autónomos en módulos tienen una fiscalidad distinta: la cuota se calcula sobre unidades físicas, no sobre ingresos reales. Para esta casuística, Quipu integra facturación y el modelo 131 trimestral, y puedes combinarlo con nuestra calculadora de módulos IRPF para estimar la cuota antes de presentarla.
Mejor programa para autónomos en estimación directa
En estimación directa la base imponible depende de ingresos menos gastos deducibles reales, así que la contabilidad de gastos es crítica. Quipu es la recomendación sin matices: conciliación bancaria automática, categorización de gastos deducibles y modelos 303/130/390 listos para presentar. Si facturas muy poco, Billin con Kit Digital puede servirte como primer paso hasta que el volumen justifique el salto.
Nuestra recomendación final
Quipu para contabilidad completa, Billin para facturación simple
Nuestra recomendación por defecto es Quipu para autónomos en estimación directa con contabilidad regular, y Billin para quienes facturen poco o quieran aprovechar el Kit Digital. Cualquiera de las dos cubre los mínimos legales para la facturación electrónica obligatoria 2026.
¿Quieres probar Quipu ahora?
La plataforma más usada por autónomos en España
¿Quieres probar Billin ahora?
Factura como autónomo, subvencionado por el Kit Digital